На 13 април 2013г. след повече от 200 години в парка на „МБАЛ- Самоков” ЕООД бе направена първа копка за построяване на нов православен храм в град Самоков. Името на новостроящия се храм е посветено на великия целител и великомъченик Пантелеймон. Идеята за построяването на храма възниква още през 2005 година. От управата на болницата първоначално са искали да построят параклис, където християните, намиращи се на лечение в болничното заведение да могат да попросят Божията помощ и закрила. Постепенно се оформило желанието църквата да бъде с по-големи размери, за да могат в нея да намират духовна утеха и самоковци от близкия квартал. Главен инициатор и организатор е д-р Красимира Ковачка, управител на болницата, която сформира църковно настоятелство, заема се с откриване на дарителска сметка за набиране на средства за изграждането на храма, а с архитектурния план се заема арх. Райна Куманова.
С благословението на Негово Светейшество Българския патриарх и Софийски митрополит Неофит чинопоследованието за полагане на основен камък бе извършено от Негово Преосвещенство Знеполски еп. Йоан, викарий на Софийския митрополит.
В двора на болницата се бяха събрали десетки жители на Самоков, лекари, медицински персонал и болни. Сред официалните лица бяха кметът на Самоков г-н Владимир Георгиев, председателят на Общинския съвет, управата на болничното заведение, сестрите от Самоковския манастир, местни общественици, бизнесмени и др.След като бе направен водосвет, епископът положи първия камък в основите на бъдещия храм и съгласно традицията, до камъка постави стъкленица, в която бе сложен специален свитък с имената на ктиторите.